人類の敵ノヴァと戦うカズヤとサテライザー、
2人は仲間達と供に力を合わせて幾多の戦いを切り抜けて行く。
暴走するレジェンドパンドラに苦戦するパンドラ達、
しかし突如現れた謎の少女「アルカディア」の活躍によって事態は収拾するのであった。
戦いを終え、束の間の休息を得る少年と少女達。
一方、次なる戦いを前にアオイ＝源吾は、
ノヴァという存在と隠されていた世界の真実を明かすのであった…。