人類の敵ノヴァと戦うための人材を教育する機関
ゼネティックスに所属するカズヤとサテライザー、
2人は力を合わせ厳しい戦いを切り抜けて行くのであった。

パンドラとヴァルキリーの
混合部隊である第13小隊配属のため、
再び集まった世界ランクのパンドラ達、
しかしアラスカ事件で対立してしまった
シャルルとサテライザー達は険悪なムードに、
さらにエリザベス負傷の原因となったシャルルに対し、
アーネット組も動き出し…。